Мы используем cookie файлы.
Пользуясь сайтом, вы соглашаетесь с нашей Политикой конфиденциальности.

Приглашенный ученый Шедл Пол США
Номер договора
14.B25.31.0022
Период реализации проекта
2013-2017
Заведующий лабораторией

По данным на 15.02.2021

15
Количество специалистов
47
научных публикаций
Общая информация

Исследования лаборатории связаны с выяснением молекулярных механизмов, регулирующих экспрессию генов. Экспрессия генов - фундаментальный процесс, лежащий в основе жизнедеятельности организма. Он включает в себя ряд последовательных молекулярных стадий: подготовка матрицы хроматина, транскрипция ДНК, созревание мРНК и формирование рибонуклеопротеиновых частиц, их внутриклеточный транспорт и трансляция на рибосомах. Каждая из указанных стадий контролируется определенным набором факторов - молекулярных машин, которые обычно представлены мультисубъединичными белковыми комплексами. Взаимодействие и согласованное привлечение различных факторов обеспечивает координацию отдельных этапов в единый процесс и точный контроль активности генов.

Название проекта: Изучение молекулярных основ регуляции экспрессии генов в развитии Drosophila

Приоритет СНТР: в

Цели и задачи

Направление исследований: Молекулярные основы регуляции функционирования генов в процессе развития организма

Цель проекта: Изучить молекулярные основы регуляции экспрессии генов в развитии Drosophila

Практическое значение исследования
Научные результаты:

  • Изучена роль белков семейства CPEB – orb и orb2 – в регуляции поляризации тканей и развития семенников и яичников дрозофилы. Исследованы механизм контроля спецификации и поддержания статуса первичных стволовых клеток в гонадах дрозофилы.
  • Изучены новые белковые факторы, обеспечивающие дальние взаимодействия на модели генного комплекса bithorax в эмбрионах дрозофилы. Представлено сравнительное описание различных инсуляторов генного комплекса bithorax.
  • Исследованы механизмы действия белков и белковых комплексов Elba, Insv, ENY2, SAYP, LBC в регуляции активности генов в ходе развития дрозофилы.
  • Изучены молекулярные основы явления дозовой компенсации у дрозофилы, изучен механизм привлечения комплексов дозовой компенсации на Х-хромосому дрозофилы.
  • Исследованы молекулярные механизмы контроля активности энхансеров, функционирования инсуляторов, формирования высших структур хроматина. Изучена структура архитектурных факторов хроматина, транскрипционных факторов и РНК-связывающих белков, контролирующих экспрессию генов. Предложены новые модели различных стадий процесса экспрессии генов. Выявлены молекулярные основы ряда процессов онтогенеза, формирования клеточной полярности, функционирования нервной системы.

Образование и переподготовка кадров:

  • Проведена международная конференция молодых ученых Molecular Control of Gene Expression, 18.06.2015 – 19.06.2015, Москва, Россия.

  • Направлены на стажировку в Университет Принстона три сотрудника лаборатории.

  • Выполнено и защищено более 10 дипломных проектов магистров и специалистов, 7 кандидатских и 4 докторских диссертации.

  • Подготовлен образовательный курс «Молекулярные основы регуляции экспрессии генов у эукариот», авторы – проф. Пол Шедл и д.б.н., проф. РАН Ю.В. Шидловский.
  • Проведена школа-конференция для молодых ученых.

  • Проводится обучение студентов РНИМУ им. Н.И. Пирогова.

Организационные и инфраструктурные преобразования:

В 2017 году лаборатория преобразована в Отдел регуляции экспрессии генов, включивший также близкие по профилю лаборатории. Научное руководство Отделом осуществляет ведущий ученый Пол Шедл.

Сотрудничество:

  • Princeton University, USA, совместные исследования, публикации.

  • The Scripps Research Institute, USA, совместные исследования, публикации.

  • Università degli Studi di Napoli "Federico II", Italy, совместные исследования, публикации.

  • Institute of research on terrestrial ecosystems (IRET), CNR, Italy, совместные исследования, публикации.

  • FAME Laboratory, Centre for Research and Technology Thessaly, Greece, совместные исследования, публикации.

  • Laboratory of Immunopathology, Instytut Immunologii i Terapii Doświadczalnej im. Ludwika Hirszfelda Polskiej Akademii Nauk, Poland, совместные исследования, публикации.

  • Научный центр генетики и наук о жизни, НТУ Сириус, Сочи, совместные исследования, публикации.

  • Лаборатория передачи внутриклеточных сигналов в норме и патологии Института молекулярной биологии РАН, Москва, совместные исследования, публикации.

  • Лаборатория биохимической генетики животных Института молекулярной генетики, Москва, совместные исследования, публикации.

  • Лаборатория нейрогенетики Института физиологии им. И.П. Павлова РАН, Санкт-Петербург, совместные исследования, публикации.

  • Научно-образовательный центр «Фотоника и ИК-техника» МГТУ им. Н.Э. Баумана, Москва, совместные исследования, публикации.

  • Кафедра биологии и общей генетики Лечебного факультета ПМГМУ им. И.М. Сеченова, Москва, совместные исследования, публикации.

Скрыть Показать полностью
Maksimenko O., Bartkuhn M., Stakhov V., Herold M., Zolotarev N., Jox T., Buxa M.K., Kirsch R., Bonchuk A., Fedotova A., Kyrchanova O., Renkawitz R., Georgiev P.
Two New Insulator Proteins, Pita and ZIPIC, Target CP190 to Chromatin. Genome Research 25(1): 89–99 (2015).
Bonchuk A., Maksimenko O., Kyrchanova O., Ivlieva T., Mogila V., Deshpande G., Wolle D., Schedl P., Georgiev P.
Functional Role of Dimerization and CP190 Interacting Domains of CTCF Protein in Drosophila Melanogaster. BMC Biology 13(1): 63 (2015).
Erokhin M., Elizar'ev P., Parshikov A., Schedl P., Georgiev P., Chetverina D.
Transcriptional Read-Through is not Sufficient to Induce an Epigenetic Switch in the Silencing Activity of Polycomb Response Elements. Proceedings of the National Academy of Sciences 112(48): 14930–14935 (2015).
Deshpande G., Manry D., Jourjine N., Mogila V., Mozes H., Bialistoky T., Gerlitz O., Schedl P.
Role of the ABC Transporter Mdr49 in Hedgehog Signaling and Germ Cell Migration. Development 143(12): 2111–2120 (2016).
Kyrchanova O., Mogila V., Wolle D., Deshpande G., Parshikov A., Cléard F., Karch F., Schedl P., Georgiev P.
Functional Dissection of the Blocking and Bypass Activities of the Fab-8 Boundary in the Drosophila Bithorax Complex. PLoS Genetics 12(7): e1006188 (2016).
M. Fujioka, H. Mistry, P. Schedl, J. Jaynes
Determinants of Chromosome Architecture: Insulator Pairing in cis and in trans. PLoS Genet (2016) 24;12(2):e1005889.
Postika N, Metzler M, Affolter M, Müller M, Schedl P, Georgiev P, Kyrchanova O.
Boundaries mediate long-distance interactions between enhancers and promoters in the Drosophila Bithorax complex. PLoS Genet. (2018) 14(12):e1007702.
Kyrchanova O, Kurbidaeva A, Sabirov M, Postika N, Wolle D, Aoki T, Maksimenko O, Mogila V, Schedl P, Georgiev P.
The bithorax complex iab-7 Polycomb response element has a novel role in the functioning of the Fab-7 chromatin boundary. PLoS Genet. (2018) 14(8):e1007442.
Barr J., Charania S., Gilmutdinov R., Yakovlev K., Shidlovskii Y., Schedl P.
The CPEB translational regulator, Orb, functions together with Par proteins to polarize the Drosophila oocyte. PLoS Genetics(2019) 15(3):e1008012
Kyrchanova O, Sabirov M, Mogila V, Kurbidaeva A, Postika N, Maksimenko O, Schedl P, Georgiev P.
Complete reconstitution of bypass and blocking functions in a minimal artificial Fab-7 insulator from Drosophila bithorax complex. Proc Natl Acad Sci USA. (2019); 116(27):13462-13467.
Фотоальбомы
Вторник , 03.12.2019
Другие лаборатории и ученые
Лаборатория, принимающая организация
Область наук
Город
Приглашенный ученый
Период реализации проекта
Научно-исследовательская лаборатория "Регуляторная геномика"

Казанский (Приволжский) федеральный университет

Биология

Казань

Хаяшизаки Йошихиде

Япония

2021-2023

Лаборатория статистической мультиомики и биоинформатики

Уфимский федеральный исследовательский центр Российской академии наук

Биология

Уфа

Прокопенко Инга Анатольевна

Великобритания

2021-2023

Лаборатория молекулярной онкобиологии

Институт биологии гена Российской академии наук

Биология

Москва

Ронинсон Игорь

США

2018-2022