Мы используем cookie файлы.
Пользуясь сайтом, вы соглашаетесь с нашей Политикой конфиденциальности.

Приглашенный ученый Прокопенко Инга Анатольевна Великобритания
Период реализации проекта
2021-2023
Общая информация

Название проекта:  Разработка высокопроизводительных вычислительных инструментов для комплексного анализа мультиомиксных данных и развития персонализированной медицины

Приоритет СНТР: в

Цели и задачи

Проект направлен на разработку высокопроизводительных вычислительных инструментов для комплексного анализа мультиомиксных данных и развития персонализированной медицины. С этой целью планируется создание в Институте биохимии и генетики Уфимского федерального исследовательского центра Российской академии наук (ИБГ УФИЦ РАН) лаборатории статистической мультиомики и биоинформатики, а также кластера высокопроизводительных вычислений (high-performance computing cluster) и открытой онлайн-платформы для сбора и анализа данных. Исследование будет проводиться с использованием существующих биообразцов и фенотипических данных из коллекции биологических материалов человека ИБГ УФИЦ РАН, являющейся центром по депонированию и хранению уникальных генетических банков ДНК коренных жителей различных регионов России, а также пациентов и членов их семей с различными заболеваниями.

Также планируется расширение биоресурсной коллекции ИБГ УФИЦ РАН за счёт пополнения глубоко фенотипированной выборки и проведение полногеномного гентипирования для изучения молекулярных механизмов, лежащих в основе формирования сложных признаков, в том числе кардиометаболических особенностей, когнитивных способностей, индивидуального психологического профиля (склонности к агрессивному поведению и депрессии), спортивных характеристик.

Для достижения поставленных в проекте целей будут применяться методы мультифенотипического анализа, разработанные под руководством Инги Прокопенко и апробированные с использованием крупных баз генетических и клинических данных, таких, как UK Biobank.

Практическое значение исследования
В результате выполнения проекта будут получены новые сведения о биологических механизмах формирования сложных признаков, а также выявлены информативные предикторы социально-значимых заболеваний, образующих континуум, в том числе сердечно-сосудистых заболеваний (артериальная гипертензия, инфаркт миокарда), метаболических (сахарный диабет 2 типа, ожирение, метаболический синдром, остеопороз), болезней дыхательной системы (бронхиальная астма, хроническая обструктивная болезнь легких), различных видов рака.
Помимо этого, в результате осуществления проекта будет создана онлайн-платформа для сбора и анализа мультиомиксных данных, включая данные глубокого фенотипирования, геномные, эпигеномные, метиломные, микробиомные данные, а также кластерная платформа, позволяющая проводить анализ больших данных. В результате выполнения проекта будут получены данные, которые не только расширят наши представления о патофизиологических процессах, лежащих в основе формирования сложных признаков как в норме, так и при патологии, но и послужат основой для создания новых методов диагностики и подходов таргетной терапии.

Выполнение работ по проекту приведет к созданию инфраструктуры, которая в будущем позволит проводить углубленные генетические исследования с использованием мультиэтнических российских выборок.
Скрыть Показать полностью
Другие лаборатории и ученые
Лаборатория, принимающая организация
Область наук
Город
Приглашенный ученый
Период реализации проекта
Научно-исследовательская лаборатория "Регуляторная геномика"

Казанский (Приволжский) федеральный университет

Биология

Казань

Хаяшизаки Йошихиде

Япония

2021-2023

Лаборатория молекулярной онкобиологии

Институт биологии гена Российской академии наук

Биология

Москва

Ронинсон Игорь

США

2018-2022

Лаборатория эпигенетики

Новосибирский национальный исследовательский государственный университет

Биология

Новосибирск

Сингх Прим

Великобритания

2018-2020