Название проекта: Разработка высокопроизводительных вычислительных инструментов для комплексного анализа мультиомиксных данных и развития персонализированной медицины
Приоритет СНТР: в
Проект направлен на разработку высокопроизводительных вычислительных инструментов для комплексного анализа мультиомиксных данных и развития персонализированной медицины. С этой целью планируется создание в Институте биохимии и генетики Уфимского федерального исследовательского центра Российской академии наук (ИБГ УФИЦ РАН) лаборатории статистической мультиомики и биоинформатики, а также кластера высокопроизводительных вычислений (high-performance computing cluster) и открытой онлайн-платформы для сбора и анализа данных. Исследование будет проводиться с использованием существующих биообразцов и фенотипических данных из коллекции биологических материалов человека ИБГ УФИЦ РАН, являющейся центром по депонированию и хранению уникальных генетических банков ДНК коренных жителей различных регионов России, а также пациентов и членов их семей с различными заболеваниями.
Также планируется расширение биоресурсной коллекции ИБГ УФИЦ РАН за счёт пополнения глубоко фенотипированной выборки и проведение полногеномного гентипирования для изучения молекулярных механизмов, лежащих в основе формирования сложных признаков, в том числе кардиометаболических особенностей, когнитивных способностей, индивидуального психологического профиля (склонности к агрессивному поведению и депрессии), спортивных характеристик.
Для достижения поставленных в проекте целей будут применяться методы мультифенотипического анализа, разработанные под руководством Инги Прокопенко и апробированные с использованием крупных баз генетических и клинических данных, таких, как UK Biobank.
Лаборатория, принимающая организация
|
Область наук
|
Город
|
Приглашенный ученый
|
Период реализации проекта
|
---|---|---|---|---|
Научно-исследовательская лаборатория "Регуляторная геномика"
Казанский (Приволжский) федеральный университет |
Биология |
Казань |
Хаяшизаки Йошихиде
Япония |
2021-2023 |
Лаборатория молекулярной онкобиологии
Институт биологии гена Российской академии наук |
Биология |
Москва |
Ронинсон Игорь
США |
2018-2022 |
Лаборатория эпигенетики
Новосибирский национальный исследовательский государственный университет |
Биология |
Новосибирск |
Сингх Прим
Великобритания |
2018-2020 |