Мы используем cookie файлы.
Пользуясь сайтом, вы соглашаетесь с нашей Политикой конфиденциальности.

Приглашенный ученый Прокопенко Инга Анатольевна Великобритания
Период реализации проекта
2021-2023
Общая информация

Название проекта:  Разработка высокопроизводительных вычислительных инструментов для комплексного анализа мультиомиксных данных и развития персонализированной медицины

Приоритет СНТР: в

Цели и задачи

Проект направлен на разработку высокопроизводительных вычислительных инструментов для комплексного анализа мультиомиксных данных и развития персонализированной медицины. С этой целью планируется создание в Институте биохимии и генетики Уфимского федерального исследовательского центра Российской академии наук (ИБГ УФИЦ РАН) лаборатории статистической мультиомики и биоинформатики, а также кластера высокопроизводительных вычислений (high-performance computing cluster) и открытой онлайн-платформы для сбора и анализа данных. Исследование будет проводиться с использованием существующих биообразцов и фенотипических данных из коллекции биологических материалов человека ИБГ УФИЦ РАН, являющейся центром по депонированию и хранению уникальных генетических банков ДНК коренных жителей различных регионов России, а также пациентов и членов их семей с различными заболеваниями. Также планируется расширение биоресурсной коллекции ИБГ УФИЦ РАН за счёт пополнения глубоко фенотипированной выборки и проведение полногеномного гентипирования для изучения молекулярных механизмов, лежащих в основе формирования сложных признаков, в том числе кардиометаболических особенностей, когнитивных способностей, индивидуального психологического профиля (склонности к агрессивному поведению и депрессии), спортивных характеристик. Для достижения поставленных в проекте целей будут применяться методы мультифенотипического анализа, разработанные под руководством И. Прокопенко и апробированные с использованием крупных баз генетических и клинических данных, таких, как UK Biobank.

Практическое значение исследования
В результате выполнения проекта будут получены новые сведения о биологических механизмах формирования сложных признаков, а также выявлены информативные предикторы социально-значимых заболеваний, образующих континуум, в том числе сердечно-сосудистых заболеваний (артериальная гипертензия, инфаркт миокарда), метаболических (сахарный диабет 2 типа, ожирение, метаболический синдром, остеопороз), болезней дыхательной системы (бронхиальная астма, хроническая обструктивная болезнь легких), различных видов рака. Помимо этого, в результате осуществления проекта будет создана онлайн-платформа для сбора и анализа мультиомиксных данных, включая данные глубокого фенотипирования, геномные, эпигеномные, метиломные, микробиомные данные, а также кластерная платформа, позволяющая проводить анализ больших данных. В результате выполнения проекта будут получены данные, которые не только расширят наши представления о патофизиологических процессах, лежащих в основе формирования сложных признаков как в норме, так и при патологии, но и послужат основой для создания новых методов диагностики и подходов таргетной терапии.

Выполнение работ по проекту приведет к созданию инфраструктуры, которая в будущем позволит проводить углубленные генетические исследования с использованием мультиэтнических российских выборок.
Скрыть Показать полностью
Другие лаборатории и ученые
Лаборатория, принимающая организация
Область наук
Город
Приглашенный ученый
Период реализации проекта
Лаборатория. Приглашенный ученый Хаяшизаки Йошихиде

Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Казанский (Приволжский) федеральный университет"

Биология

Казань

Хаяшизаки Йошихиде

Япония

2021-2023

Научно-производственный биотехнологический комплекс для проведения работ по изучению, сохранению и практическому применению культивируемых клеток и органов высших растений и микроводорослей

Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт физиологии растений им. К.А. Тимирязева Российской академии наук

Биология

Москва

Пэк КиЙоп

Корея

2019-2021

Лаборатория клеточной физиологии и патологии

Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Орловский государственный университет имени И.С. Тургенева"

Биология

Орел

Абрамов Андрей Юрьевич

Россия

2019-2021