Мы используем cookie файлы.
Пользуясь сайтом, вы соглашаетесь с нашей Политикой конфиденциальности.

Приглашенный ученый Хаяшизаки Йошихиде Япония
Период реализации проекта
2021-2023
Общая информация

Название проекта:  Регуляторные генетические и эпигенетические механизмы развития и функционирования скелетных и сердечной мышц человека и приматов в норме и патологии

Приоритет СНТР: в


Цели и задачи

Основной целью данного исследования является определение ландшафта активности регуляторных элементов генома во взрослых и развивающихся скелетных и сердечных мышцах человека и приматов в норме и патологии. Для достижения этой цели необходимо будет провести сбор образцов разных типов скелетных и сердечных мышц человека и млекопитающих (макак). Организация биобанка образцов мышц будет одной из важных задач. С использованием современных методов оценки активности генов на уровне целого генома (CAGE-seq RNA-seq) и их регуляторных элементов (ATAC-seq), а также их вариаций на уровне отдельных клеток, будет решаться задача получения массива данных секвенирования. Полученные данные будут обрабатываться группой биоинформатиков, имеющих опыт выполнения крупных международных проектов, а также используя для сравнения результаты серии проектов FANTOM (2000-2018), базирующихся на той же технологической платформе (CAGE-seq).

В результате планируется создать атлас экспрессионной активности, реконструкцию генных сетей, регулирующих молекулярные процессы в мышечных клетках и тканях в норме и патологии.

Практическое значение исследования

В результате выполнения проекта ожидается создание биобанка образцов мышц человека в норме и патологии с сопровождением имеющейся клинической информации.

Будет создана база данных, доступная мировому научному сообществу через Web-интерфейс и систематизирующая все полученные данные.

Будут выявлены новые регуляторные элементы (промоторы и энхансеры), восстановлены регуляторные сети, специфичные для конкретных типов мышц.

Будут идентифицированы возраст- и патология-зависимые изменения в активности регуляторных элементов, а также значительно расширены знания о связи мутаций в регуляторных элементах с патологиями скелетных и сердечных мышц.

Скрыть Показать полностью
Другие лаборатории и ученые
Лаборатория, принимающая организация
Область наук
Город
Приглашенный ученый
Период реализации проекта
Лаборатория. Приглашенный ученый Прокопенко Инга Анатольевна

Федеральное государственное бюджетное научное учреждение Уфимский федеральный исследовательский центр Российской академии наук

Авиакосмическая техника

Уфа

Прокопенко Инга Анатольевна

Великобритания

2021-2023

Научно-производственный биотехнологический комплекс для проведения работ по изучению, сохранению и практическому применению культивируемых клеток и органов высших растений и микроводорослей

Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт физиологии растений им. К.А. Тимирязева Российской академии наук

Авиакосмическая техника

Москва

Пэк КиЙоп

Корея

2019-2021

Лаборатория клеточной физиологии и патологии

Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Орловский государственный университет имени И.С. Тургенева"

Авиакосмическая техника

Орел

Абрамов Андрей Юрьевич

Россия

2019-2021