Мы используем cookie файлы.
Пользуясь сайтом, вы соглашаетесь с нашей Политикой конфиденциальности.

Приглашенный ученый Хаяшизаки Йошихиде Япония
Период реализации проекта
2021-2023
Общая информация
Название проекта:  Регуляторные генетические и эпигенетические механизмы развития и функционирования скелетных и сердечной мышц человека и приматов в норме и патологии

Приоритет СНТР: в

Цели и задачи

Основной целью данного исследования является определение ландшафта активности регуляторных элементов генома во взрослых и развивающихся скелетных и сердечных мышцах человека и приматов в норме и патологии. Для достижения этой цели необходимо будет провести сбор образцов разных типов скелетных и сердечных мышц человека и млекопитающих (макак). Организация биобанка образцов мышц будет одной из важных задач. С использованием современных методов оценки активности генов на уровне целого генома (CAGE-seq RNA-seq) и их регуляторных элементов (ATAC-seq), а также их вариаций на уровне отдельных клеток, будет решаться задача получения массива данных секвенирования. Полученные данные будут обрабатываться группой биоинформатиков, имеющих опыт выполнения крупных международных проектов, а также используя для сравнения результаты серии проектов FANTOM (2000-2018), базирующихся на той же технологической платформе (CAGE-seq).

В результате планируется создать атлас экспрессионной активности, реконструкцию генных сетей, регулирующих молекулярные процессы в мышечных клетках и тканях в норме и патологии.

Практическое значение исследования

В результате выполнения проекта ожидается создание биобанка образцов мышц человека в норме и патологии с сопровождением имеющейся клинической информации.

Будет создана база данных, доступная мировому научному сообществу через Web-интерфейс и систематизирующая все полученные данные.

Будут выявлены новые регуляторные элементы (промоторы и энхансеры), восстановлены регуляторные сети, специфичные для конкретных типов мышц.

Будут идентифицированы возраст- и патология-зависимые изменения в активности регуляторных элементов, а также значительно расширены знания о связи мутаций в регуляторных элементах с патологиями скелетных и сердечных мышц.

Скрыть Показать полностью
Другие лаборатории и ученые
Лаборатория, принимающая организация
Область наук
Город
Приглашенный ученый
Период реализации проекта
Лаборатория статистической мультиомики и биоинформатики

Федеральное государственное бюджетное научное учреждение Уфимский федеральный исследовательский центр Российской академии наук

Биология

Уфа

Прокопенко Инга Анатольевна

Великобритания

2021-2023

Лаборатория молекулярной онкобиологии

Федеральное государственное бюджетное учреждение науки «Институт биологии гена Российской академии наук»

Биология

Москва

Ронинсон Игорь

США

2018-2022

Лаборатория эпигенетики

Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования «Новосибирский национальный исследовательский государственный университет»

Биология

Новосибирск

Сингх Прим

Великобритания

2018-2020