Мы используем cookie файлы.
Пользуясь сайтом, вы соглашаетесь с нашей Политикой конфиденциальности.

Приглашенный ученый Крутовский Константин Валерьевич Россия, США
Номер договора
14.Y26.31.0004
Период реализации проекта
2014-2018

По данным на 30.01.2020

10
Количество специалистов
93
научных публикаций
150
Объектов интеллектуальной собственности
Общая информация

Лиственница и сосна - важнейшие компоненты бореальных лесов Сибири, имеющие огромное экономическое, экологическое и эстетическое значение и, играющие важнейшую биосферную роль в регуляции глобального климата. Однако, изучение лиственницы, сосны и других важных пород хвойных, таких как сосна сибирская кедровая, тормозится практически полным отсутствием данных об их геноме и генах, контролирующих важные адаптивные и селекционные признаки. Ученые лаборатории проводят  сравнительный анализ и аннотирование геномов основных лесообразующих пород Российской Федерации – лиственницы сибирской, сосны обыкновенной и сосны кедровой сибирской, а также их наиболее опасных патогенов, в первую очередь, грибов, которые вызывают катастрофическое усыхание российских бореальных лесов.

Название проекта: Геномные исследования основных бореальных лесообразующих хвойных видов и их наиболее опасных патогенов в Российской Федерации


Цели и задачи
Направления исследований: Полногеномное секвенирование и аннотация, сравнительная геномика, биоинформатика

Цель проекта:

  • Создание лаборатории лесной геномики; изучение геномов основных лесообразующих пород РФ и их наиболее опасных патогенов (в первую очередь, грибов), которые вызывают катастрофическое усыхание российских бореальных лесов
  • Разработка молекулярно-генетических маркеров для определения происхождения древесины, мониторинга генетической изменчивости хвойных лесов, их адаптации к изменению климата и для создания селекционных и природоохранных программ
Практическое значение исследования
Научные результаты:

  • Получена коллекция ДНК из гаплоидной и диплоидной ткани лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.), сосны кедровой сибирской (Pinus sylvestris L.) и проведены все этапы подготовки ее к секвенированию. Созданы библиотеки разной фрагментированности ДНК для секвенирования.
  • Осуществлены секвенирование, первичная сборка и аннотирование геномов для L. sibirica (предполагаемый размер генома 12,03 Gbp) и P. sibirica (предполагаемый размер генома 28,9 Gbp) с использованием оригинального, разработанного в лаборатории метода поэтапной сборки больших геномов. Проведена аннотация геномов.
  • Проведены de novo сборка и аннотирование транскриптома лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) и анализ его статистических и комбинаторных свойств.
  • Подготовлены и отсеквенированы транскриптомные библиотеки из различных тканей хвои, почек, молодых побегов, женских шишек, ксилемы и т. п. для глубокого аннотирования геномов хвойных. Проведена биоинформатическая обработка данных секвенирования транскриптомов.
  • Проведена работа по сканированию нуклеотидных сиквенсов гаплоидных мегагаметофитов с целью поиска мутаций и полиморфных сегрегирующих SNPs.
  • Проведен поиск микросателлитных локусов в геномах лиственницы сибирской, сосны кедровой сибирской и пихты сибирской. Осуществлен дизайн, синтез и тестирование соответствующих ПЦР-праймеров для их амплификации. Составлен и описан каталог микросателлитных (SSR) локусов для этих видов.
  • Осуществлена сборка митохондриальных геномов путем отбора именно митохондриальных контигов и скаффолдов лиственницы сибирской, сосны сибирской кедровой и сосны обыкновенной.
  • Осуществлена полная сборка и аннотирование хлоропластного генома лиственницы сибирской. Длина хлоропластного генома L. sibirica составила 122561 bp и близка к 122474 bp у близкородственной Larix decidua Mill. На основе собранного хлоропластного генома лиственницы сибирской осуществлен поиск полиморфных генетических маркеров – простых микросателлитных повторов (SSRs) и однонуклеотидных полиморфизмов (SNP). Ассемблирование производилось с использованием программ картирования Bowtie2 и геномного ассемблера SPAdes. Было найдено 13 SNPs, два из них находятся в кодирующих участках генома: tRNA-Arg и Cell division protein FtsH.
  • Отработана методика ddRADseq (double digestion Restriction site Associated DNAs sequencing) – метод генотипирования посредством секвенирования. Полученные данные позволили начать работать с привязкой геномных сборок, полученных из референсных деревьев к генетическим картам сцепления.
  • Проведен подробный сравнительный анализ митохондриальных геномов Armillaria borealis, A. sinapina и A. ostoyae. Во всех трех геномах были найдены дупликации некоторых генов и встроенные плазмиды.
  • Проведено секвенирование образцов A. borealis, культивированных в разных средах для анализа дифференциальной экспрессии генов и выявления более агрессивных (и, предположительно, более патогенных) штаммов и генов-кандидатов на патогенность. Выполнена биоинформатическая обработка данных секвенирования. Проведена оценка качества результатов секвенирования. По результатам сборки проведен сравнительный анализ между контрастными по уровню патогенности штаммами грибов.
  • Выполнена биоинформатическая обработка данных секвенирования геномов грибов Armillaria mellea s. l. Проведена оценка качества сборки. Произведен анализ повторяющихся элементов в геномах грибов. Впервые собраны митохондриальные геномы представителей комплекса A. mellea s. l. Начата работа по изучению видового разнообразия грибов комплекса A. mellea s. l. на территории Сибири и Дальнего Востока с использованием генетических подходов.

Внедрение результатов исследования:

Получено 5 свидетельств о государственной регистрации программ для ЭВМ и 1 патент.

Образование и переподготовка кадров:

  • Разработаны 16 учебно-методических курсов в рамках магистерской программы: «Геномика и биоинформатика»: «Молекулярная экология», «Популяционная генетика», «Геномика», «Лесопатологический мониторинг», «Технологии защиты леса», «Введение в биоинформатику», «Программирование на Python», «Генетика человека», «Протеомика», «Геномика и биоинформатика», «Современные методы анализа многомерных данных в биологии», «Спецпрактикум “Методы молекулярно-генетических исследований”», «Теория отбора», «Иммуногенетика», «Биоинженерия растений», «Практическая биоинформатика».

  • В лаборатории за 4 года прошли профессиональную переподготовку и повышение квалификации по направлению научного исследования из сторонних организаций 36 человек (в основном молодые специалисты из Института леса имени В. Н. Сукачева СО РАН и сотрудники филиалов «Рослесозащиты»).

Организационные и инфраструктурные преобразования:

На базе лаборатории функционирует Научно-образовательный центр геномных исследований Сибирского федерального университета, который выполняет также роль центра коллективного пользования уникальным оборудованием для полногеномного секвенирования.

Другие результаты:

Лаборатория участвует в разработке первого отечественного секвенатора ДНК третьего поколения, осуществляемого стартапом «ГАММА-ДНК» получившем грант фонда «Сколково». Руководитель лаборатории К. В. Крутовский является одним из 6 авторов оригинального метода секвенирования, получившего международный патент и одним из 9 участников проекта.

Сотрудничество:

  • Лаборатория популяционной генетики имени Ю. П. Алтухова Института общей генетики имени Н. И. Вавилова РАН (Россия), Отдел мониторинга состояния лесных генетических ресурсов Филиала ФБУ «Рослесозащита» «Центр защиты леса Красноярского края» (Россия): совместные исследования и совместные научные мероприятия.

  • Лаборатория лесной генетики и селекции Института леса имени В. Н. Сукачева СО РАН (Россия), Лаборатория молекулярной экологии растений Института экологии растений и животных УрО РАН (Россия), Лаборатория Музей мамонта имени П. А. Лазарева Северо-Восточного федерального университета (Россия), Лаборатория идентификации объектов биологического происхождения Южного федерального университета (Россия), Хакасский технический институт (Россия), Центр высокопроизводительных вычислений Института космических и информационных технологий Сибирского федерального университета (Россия), Центр биоинформатики Университета Хайфы (Израиль): совместные исследования.

  • Отдел лесной генетики и селекции Геттингенского университета имени Георга-Августа (Германия): совместные исследования и стажировки в Геттингенском университете сотрудников и студентов лаборатории.
научные результаты
 1) Впервые было осушествлено полное описание, филогенетическое изучение и тестирование на разных средах гриба-трутовика Porodaedalea niemela, обитающего на самой северной границе бореальных лесов на полуострове Таймыр, а также впервые был секвенирован и аннотирован геном данного гриба (К. Крутовский - рук. геномного проекта данного гриба совместно с Объединённым Геномным Институтом Министерства энергетики США):

Pavlov, I. N., Y. A Litovka, T. V. Ryazanova, N. A. Chuprova, Y. A. Putintseva, K. V. Krutovsky, 2018 Pathogenic and wood- destroying properties of Porodaedalea niemela M. Fischer in the open woodlands of Larix gmelinii in the permafrost area. Journal of Siberian Federal University. Biology 11(4): 30-48 DOI: 10.17516/1997-1389-0039 http://elib.sfu-kras.ru/bitstream/2311/70290/8/03_Pavlov_15_05.pdf

2) На основе полногеномных данных, полученных в проектах К. Крутовского были разработаны новые полиморфные маркёры для популяционно-генетических, филогенетических и геногеографических исследований сосны обыкновенной, сосны сибирской кедровой и лиственницы сибирской:

Krutovsky K. V., Y. A. Putintseva, N. V. Oreshkova, E. I. Bondar, V. V. Sharov, D. A. Kuzmin 2019 Postgenomic technologies in practical forestry: development of genome-wide markers for timber origin identification and other applications. Forest Engineering Journal 9(1): 9-16 (Лесотехнический журнал) (ИФ РИНЦ = 0.457) (https://doi.org/10.12737/article_5c92016b64af27.15390296)

Орешкова, Н. В., Е. И. Бондар, Ю. А. Путинцева, В. В. Шаров, Д. А. Кузьмин, К. В. Крутовский, 2019 Разработка ядерных микросателлитных маркеров с длинными (трех-, четырех-, пяти- и шестинуклеотидными) мотивами для трёх видов лиственницы на основе полногеномного de novo секвенирования лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.). Генетика 55(4): 418-425 (Oreshkova N. V., E. I. Bondar, Yu. A. Putintseva, V. V. Sharov, D. A. Kuzmin, K. V. Krutovsky, 2019 Development of nuclear microsatellite markers with long (tri-, tetra-, penta-and hexanucleotide) motifs for three larch species based on the de novo whole genome sequencing of Siberian larch (Larix sibirica Ledeb.). Russian Journal of Genetics 55(4): 444-450 DOI: 10.1134/S1022795419040094 (IF = 0.575; Q4)

Semerikov V. L., S. A. Semerikova, Y. A. Putintseva, N. V. Oreshkova, K. V. Krutovsky 2019 Mitochondrial DNA in Siberian conifers indicates multiple postglacial colonization centers. Canadian Journal of Forest Research. 49(8): 875–883 https://doi.org/10.1139/cjfr-2018-0498 (IF =2.162; Q1)

Putintseva, Y. A., N. V. Oreshkova, E. I. Bondar, V. V. Sharov, D. A. Kuzmin, S. V. Makolov, Krutovsky K. V. 2018 Genomics for practical forestry: development of genome-wide markers for timber origin identification and other applications. Pp. 101-106. In Degen B, Krutovsky KV, Liesebach M (eds) Proceedings of German Russian Conference on Forest Genetics in Ahrensburg, November 21-23, 2017. Braunschweig: Johann Heinrich von Thünen-Institut, 148 p, Thünen Report 62, DOI:10.3220/REP1539855736000 (https://www.thuenen.de/media/publikationen/thuenen-report/Thuenen_Report_62.pdf)

Semerikov V. L., Semerikova S. A., Krutovsky K. V. 2018 Development of mtDNA markers for Siberian conifers and their application in phylogeographic studies. Pp. 95-100. In Degen B, Krutovsky KV, Liesebach M (eds) Proceedings of German Russian Conference on Forest Genetics in Ahrensburg, November 21-23, 2017. Braunschweig: Johann Heinrich von Thünen-Institut, 148 p, Thünen Report 62, DOI:10.3220/REP1539855736000 (https://www.thuenen.de/media/publikationen/thuenen-report/Thuenen_Report_62.pdf)

Semerikov, V.L., S.A. Semerikova, Y.A. Putintseva, V. V. Tarakanov, I. V. Tikhonova, A. I. Vidyakin, N.V. Oreshkova, and K.V. Krutovsky, 2018 Colonization history of Scots pine in Eastern Europe and North Asia based on mitochondrial DNA variation. Tree Genetics and Genomes 14:8 https://doi.org/10.1007/s11295-017-1222-0; IF = 1.624; Q1

Орешкова Н. В., Путинцева Ю. А., Шаров В. В., Кузмин Д. А., Крутовский К.В. 2017 Разработка микросателлитных маркёров лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) на основе полногеномного de novo секвенирования // Генетика. Т. 53. No 11. C. 1278–1284. (IF = 0.448) (Oreshkova, , N. V., Yu. A. Putintseva, V. V. Sharov, D. A. Kuzmin, and K. V. Krutovsky, 2017 Development of Microsatellite Genetic Markers in Siberian larch (Larix sibirica Ledeb.) Based on the De Novo Whole Genome Sequencing. Russian Journal of Genetics 53(11): 1194–1199; doi: 10.1134/S1022795417110096; https://doi.org/10.1134/S1022795417110096; IF = 0.550; Q4

3) Впервые на стыке дендрохронологии и геномики изучена с использованием полногеномных маркёров связь динамики скорости и стабильности индивидуального роста с индивидуальной гетерозиготностью у горной тсуги и лиственницы сибирской и показана большая нестабильность роста у быстрорастущих деревьев:

Johnson, J.S., P. Chhetri, K. V. Krutovsky, and D. M. Cairns, 2017 Growth and Its Relationship to Individual Genetic Diversity of Mountain Hemlock (Tsuga mertensiana) at Alpine Treeline in Alaska: Combining Dendrochronology and Genomics. Forests 8(11): 418; doi:10.3390/f8110418; http://www.mdpi.com/1999-4907/8/11/418; IF = 1.951; Q1

Babushkina E. A., E. A. Vaganov, A. M. Grachev, N. V. Oreshkova, L. V. Belokopytova, T. V. Kostyakova , and K. V. Krutovsky, 2016 The effect of individual genetic heterozygosity on general homeostasis, heterosis and resilience in Siberian larch (Larix sibirica Ledeb.) using dendrochronology and microsatellite loci genotyping. Dendrochronologia 38: 26-37; IF = 2.590; Q1

4) Впервые был секвенирован и аннотирован геном серого кита и проведён анализ генов предположительно связанных с высокой продолжительностью жизни данного вида:

Moskalev, A. А., A. V. Kudryavtseva, A. S. Grafodatsky, V. R. Beklemisheva, N. A. Serdyukova, K. V. Krutovsky, V. V. Sharov, I. V. Kulakovsky, A. S. Lando, A. S. Kasianov, A. V. Snezhkina1, D. A. Kuzmin, Y. A. Putintseva, S. I. Feranchuk, M. V. Shaposhnikov, V. Fraifeld1, M. Toren, V. V. Sitnik, 2017 De novo assembling and primary analysis of genome and transcriptome of gray whale Eschrichtius robustus. BMC Evolutionary Biology 17(Suppl 2):258; doi:10.1186/s12862-017-1103-z https://bmcevolbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12862-017-1103-z; IF = 3.221; Q1

5) Впервые секвенированы и аннотированы ядерные, митохондриальные и хлоропластные геномы важнейших древесных видов бореальных лесов Сибири – сибирской лиственниц и кедра (К. Крутовский - рук. геномного проекта, поддержанного мегагрантом Правительства РФ) а также хлоропластный геном карельской берёзы:

Shestibratov K. A., O. Yu. Baranov, E. N. Mescherova, P. S. Kiryanov, S. V. Panteleev, L. V. Mozharovskaya, K. V. Krutovsky, V. E. Padutov 2021 Structure and phylogeny of the curly birch chloroplast genome. Frontiers in Genetics 12: 625764. https://doi.org/10.3389/fgene.2021.625764 (IF = 4.888; Q2)

Putintseva Yu.A., E.I. Bondar, E.P. Simonov, V.V. Sharov, N.V. Oreshkova, D.A. Kuzmin, Yu.M. Konstantinov, V.N. Shmakov, V.I. Belkov, M.S. Sadovsky, O. Keech, K.V. Krutovsky 2020 Siberian larch (Larix sibirica Ledeb.) mitochondrial genome assembled using both short and long nucleotide sequence reads is currently the largest known mitogenome. BMC Genomics 21: 654 https://doi.org/10.1186/s12864-020-07061-4 (IF = 3.594; Q2)

Bondar E. I., Y. A. Putintseva, N. V. Oreshkova, K. V. Krutovsky 2019 Siberian larch (Larix sibirica Ledeb.) chloroplast genome and development of polymorphic chloroplast markers. BMC Bioinformatics 20(Suppl. 1): 38 doi: 10.1186/s12859-018-2571-x https://doi.org/10.1186/s12859-018-2571-x (IF = 3.242/3.213; Q1)

Kuzmin, D. A., S. I. Feranchuk, V. V. Sharov, A. N. Cybin, S. V. Makolov, Y. A. Putintseva, N. V. Oreshkova, K. V. Krutovsky 2019 Stepwise large genome assembly approach: A case of Siberian larch (Larix sibirica Ledeb.). BMC Bioinformatics 20(Suppl. 1): 37 doi: 10.1186/s12859-018-2570-y https://doi.org/10.1186/s12859-018-2570-y (IF = 3.242/3.213; Q1)

6) Впервые полностью просеквенирован и собран митохондриальный геном шерстистого мамонта:

Kornienko I.V., Faleeva T.G., Oreshkova N.V., Grigoriev S.E., Grigoreva L.V., Simonov E.P., Kolesnikova A.I., Putintseva Yu.A., Krutovsky K.V. 2018 Complete mitochondrial genome of a woolly mammoth (Mammuthus primigenius) from Maly Lyakhovsky Island (New Siberian Islands, Russia) and its phylogenetic assessment. Mitochondrial DNA Part B. Resources 3(2): 596-598 http://dx.doi.org/10.1080/23802359.2018.1473721 (IF = 0.490; Q4)

Kornienko I. V., Faleeva T. G., Oreshkova N. V., Grigoriev S. E., Grigoreva L. V., Putintseva Yu. A., Krutovsky K. V. 2019 Structural and functional organization of the control region in mitochondrial DNA of wool mammoth (Mammuthus primigenius). Molecular Biology 53(4): 560–570 (IF = 1.023/0.978; Q4) https://link.springer.com/article/10.1134/S002689331904006X (Корниенко, И. В., Т. Г. Фалеева, Н. В. Орешкова, С. Е. Григорьев, Л. В. Григорьева, Ю. А. Путинцева, К. В. Крутовский 2019 Структурно-функциональная организация контрольного района митохондриальной ДНК шерстистого мамонта (Mammuthus primigenius). Молекулярная Биология 53(4): 627–637

7) Впервые изучены мобильные генетические элементы в митохондриальном геноме четырёх видов опят:

Kolesnikova A. I., Y. A. Putintseva, E. P. Simonov, V. V. Biriukov, N. V. Oreshkova, I. N. Pavlov, V. V. Sharov, D. A. Kuzmin, J. Anderson, K. V. Krutovsky 2019 Mobile genetic elements explain size variation in the mitochondrial genomes of four closely-related Armillaria species. BMC Genomics 20:351 https://doi.org/10.1186/s12864-019-5732-z doi: 10.1186/s12864-019-5732-z (IF = 4.093; Q1)

8) Впервые полностью секвенирован, собран и аннотирован геном бореального опёнка Armillaria borealis:

Akulova V.S., V.V. Sharov, A.I. Aksyonova, Yu.A. Putintseva, N.V. Oreshkova, S.I. Feranchuk, D.A. Kuzmin, I.N. Pavlov, Y. A. Litovka, K.V. Krutovsky 2020 De novo sequencing, assembly and functional annotation of Armillaria borealis genome. BMC Genomics 21(Suppl 7): 534. https://doi.org/10.1186/s12864-020-06964-6 (IF = 3.594; Q2)

Внедрение результатов исследования

 1) Разработан, запатентован и внедрён новый метод сборки больший геномов

2) Получен и проаннотирован геном лиственницы, который используется как референсный геном в полногеномных ассоциативных исследованиях и геномной селекции

Образование и переподготовка кадров

 1) создана новая кафедра геномики и биоинфораматики СФУ

2) разработана магистерская и аспирантская программы кафедры геномики и биоинфораматики СФУ

3) разработаны новые курсы по биоинформатике, молекулярной экологии и геномики

Инфраструктурные преобразования

создан Научно-образовательного центра геномных исследований Института фундаментальной биологии и биотехнологии Сибирского федерального университета, Красноярск (http://genome.sfu-kras.ru/en/krutovsky) с перспективой создания на его основе ЦКП геномных исследований.

сотрудничество

1) осуществляется тесное сотрудничество и совместные исследования с Институтом общей генетики им. Н. И. Вавилова РАН, Воронежским государственным лесотехническим университетом им. Г. Ф. Морозова, Филиалом Института биоорганической химии им. академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова РАН, Институтом леса им. В.Н.Сукачёва СО РАН, Российским центром защиты леса и Центром защиты леса Красноярского края

2) осуществляется международное сотрудничество и совместные исследования с Гёттингенским университетом и Институтом лесной генетики в Германии

3) участие в проектах международного консорциума по альпийской лесной геномике (AforGeN) и эволюционной лесной генетике (EvolTree).


Скрыть Показать полностью
Bondar, E. I., S. I. Feranchuk, K. A. Miroshnikova, V. V. Sharov, D. A. Kuzmin, N. V. Oreshkova, K. V. Krutovsky
2022 Annotation of Siberian larch (Larix sibirica Ledeb.) nuclear genome – one of the most cold resistant tree species in the only seasonal senescence Genus in Pinaceae. Plants 11(15): 2062. https://doi.org/10.3390/plants11152062 (IF = 4.658/4.827; Q1Scopus/Q1WoS)
Batalova, A. Y., Y. A. Putintseva, M. G. Sadovsky, K. V. Krutovsky
2022 Comparative genomics of seasonal senescence in forest trees. International Journal of Molecular Sciences 23(7): 3761. https://doi.org/10.3390/ijms23073761 (IF = 5.924/6.132; Q1Scopus/Q1WoS)
Kirichenko, A. D., A. A. Poroshina, D. Yu. Sherbakov, M. G. Sadovsky, K. V. Krutovsky
2021. Comparative analysis of alignment-free genome clustering and whole genome alignment-based phylogenomic relationship of coronaviruses. PLoS One 17(3): e0264640. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0264640 (IF = 3.240/3.788; Q1Scopus/ Q2WoS)
Bondar, E. I., M. Troukhan, K. V. Krutovsky, T. V. Tatarinova.
2022. Genome-wide prediction of transcription start sites in conifers. International Journal of Molecular Sciences 23(3), 1735; https://doi.org/10.3390/ijms23031735 (IF = 5.924/6.132; Q1/Q1)
Titievsky, A.; Putintseva, Y.A.; Taranenko, E.A.; Baskin, S.; Oreshkova, N.V.; Brodsky, E.; Sharova, A. V.; Sharov, V.V.; Panov, J.; Kuzmin, D.A.; Brodsky, L.; Krutovsky, K.V.
2021 Comparative genomics analysis of repetitive elements in ten gymnosperm species: “dark repeatome” and its abundance in conifer and Gnetum species. Life 11(11): 1234; https://doi.org/10.3390/life11111234 (IF = 3.817(2 years)/na; Q1Scopus/Q2WoS)
Putintseva Yu.A., E.I. Bondar, E.P. Simonov, V.V. Sharov, N.V. Oreshkova, D.A. Kuzmin, Yu.M. Konstantinov, V.N. Shmakov, V.I. Belkov, M.S. Sadovsky, O. Keech, K.V. Krutovsky
2020 Siberian larch (Larix sibirica Ledeb.) mitochondrial genome assembled using both short and long nucleotide sequence reads is currently the largest known mitogenome. BMC Genomics 21: 654; https://doi.org/10.1186/s12864-020-07061-4 (IF = 3.594; Q2)
Akulova V.S., V.V. Sharov, A.I. Aksyonova, Yu.A. Putintseva, N.V. Oreshkova, S.I. Feranchuk, D.A. Kuzmin, I.N. Pavlov, Y. A. Litovka, K.V. Krutovsky
2020 De novo sequencing, assembly and functional annotation of Armillaria borealis genome. BMC Genomics 21(Suppl 7): 534; https://doi.org/10.1186/s12864-020-06964-6 (IF = 3.594; Q2)
Kolesnikova A., Y. A. Putintseva, E. P. Simonov, V. V. Biriukov, N. V. Oreshkova, I. N. Pavlov, V. V. Sharov, D. A. Kuzmin, S. V. Makolov, J. Anderson, K. V. Krutovsky
2019 Mobile genetic elements explain size variation in the mitochondrial genomes of four closely-related Armillaria species. BMC Genomics 20:351; https://doi.org/10.1186/s12864-019-5732-z (IF = 3.729; Q1)
Bondar, E. I., Y. A. Putintseva, N. V. Oreshkova, K. V. Krutovsky
2019 Siberian larch (Larix sibirica Ledeb.) chloroplast genome and development of polymorphic chloroplast markers. BMC Bioinformatics 20(Suppl. 1): 38; https://doi.org/10.1186/s12859-018-2571-x (IF = 2.213; Q1)
Kuzmin, D. A., S. I. Feranchuk, V. V. Sharov, A. N. Cybin, S. V. Makolov, Y. A. Putintseva, N. V. Oreshkova, K. V. Krutovsky
2019 Stepwise large genome assembly approach: a case of Siberian larch (Larix sibirica Ledeb.). BMC Bioinformatics 20(Suppl. 1): 37; https://doi.org/10.1186/s12859-018-2570-y (IF = 2.213; Q1)
Фотоальбомы
Четверг , 02.09.2021
Четверг , 26.08.2021
Среда , 25.08.2021
Вторник , 22.12.2020
Другие лаборатории и ученые
Лаборатория, принимающая организация
Область наук
Город
Приглашенный ученый
Период реализации проекта
Центр изотопной биогеохимии

Тюменский государственный университет - (ТюмГУ)

Сельское хозяйство, лесное хозяйство, рыбное хозяйство

Тюмень

Кузяков Яков Викторович

Германия

2021-2023

Лаборатория оценки качества зерна

Омский государственный аграрный университет им. П. А. Столыпина - (Ом ГАУ)

Сельское хозяйство, лесное хозяйство, рыбное хозяйство

Омск

Коксель Хамит

Турция

2021-2023

Международная лаборатория молекулярной генетики и геномики птицы

Московская государственная академия ветеринарной медицины и биотехнологии — МВА имени К. И. Скрябина - (МГАВМиБ - МВА имени К.И. Скрябина)

Сельское хозяйство, лесное хозяйство, рыбное хозяйство

Москва

Романов Михаил Николаевич

США

2017-2019