Мы используем cookie файлы.
Пользуясь сайтом, вы соглашаетесь с нашей Политикой конфиденциальности.

Номер договора
14.B25.31.0028
Период реализации проекта
2013-2015
Заведующий лабораторией

По данным на 30.01.2020

21
Количество специалистов
31
научных публикаций
5
Объектов интеллектуальной собственности
Общая информация

Проект, реализуемый лабораторией, направлен на решение проблемы лечения бактериальных и вирусных заболеваний посредством создания эффективных и безопасных препаратов нового поколения, на основе РНК-направленных олигонуклеотидов. Сотрудники лаборатории работают над созданием антибактериальных и противовирусных препаратов на основе аналогов олигонуклеотидов и олигонуклеотидных конъюгатов, способных специфически воздействовать на бактериальные и вирусные РНК. Одним из главных результатов реализации проекта станет набор перспективных для дальнейших исследований агентов - олигонуклеотидов. В результате, пройдя все проверки, они должны стать эффективным лекарством от ряда болезней, в частности, туберкулеза. Сам профессор Альтман именует такие соединения на основе олигонуклеотидов антибиотиками будущего.

Название проекта: РНК-направленные противобактериальные и противовирусные препараты на основе олигонуклеотидов



Цели и задачи

Направления исследований: Исследование фундаментальных аспектов ДНК-диагностики и действия ген-направленных биологически активных веществ

Цель проекта: Создание антибактериальных и противовирусных препаратов на основе аналогов олигонуклеотидов и олигонуклеотидных конъюгатов, способных специфически воздействовать на бактериальные и вирусные РНК


Практическое значение исследования
  • Получены данные по антибактериальной и противовирусной активности олигонуклеотидных аналогов и конъюгатов.
  • Определена способность модифицированных олигонуклеотидных аналогов, конъюгатов и их супрамолекулярных комплексов различной структуры и состава проникать внутрь клетки.
  • Созданы лабораторные протоколы среднемасштабного синтеза, введения до- и постсинтетических модификаций, выделения и контроля качества антибактериальных и противовирусных олигонуклеотидных аналогов. Некоторые из этих протоколов могут оказаться инновациями, имеющими коммерческую ценность.
  • Отобраны олигонуклеотидные аналоги и конъюгаты, продемонстрировавшие высокую антибактериальную и противовирусную активности и способность эффективно проникать внутрь клеток и накапливаться в них.
  • Разработаны методы компьютерного моделирования, позволяющие предсказывать гибридизационные свойства ДНК-комплексов олигонуклеотидов.

Внедрение результатов исследования:

Разработаны методы и протоколы синтеза фосфорилгуанидиновых производных нуклеиновых кислот, которые успешно используются в лабораторных условиях для разработки новых антибактериальных и противовирусных соединений.

Образование и переподготовка кадров:

- Организованы стажировки в Институте биофизики СО РАН, Первом Московском государственном медицинском университете имени И. М. Сеченова, Институте хромотографии «ЭкоНова», Институте органической химии СО РАН имени Н. Н. Ворожцова по методам анализа структуры олигонуклеотидных производных и их комплексов с помощью ЯМР-спектроскопии.

- Организован курс повышения квалификации «Анализ наноразмерных объектов методом динамического светорассеивания» для сотрудников АО «Вектор-Бест».

- Защиты: 1 докторская диссертация, 5 кандидатских диссертаций, 3 выпускные квалификационные работы магистра, 4 выпускные квалификационные работы бакалавра.

Организационные и инфраструктурные преобразования:

Создано ООО «Нооген» для коммерциализации новых производных нуклеиновых кислот – фосфорилгуанидиновых олигонуклеотидов.

Другие результаты: нет

Сотрудничество:

- Новосибирский институт органической химии имени Н. Н. Ворожцова СО РАН (Россия), Институт «Международный томографический центр» СО РАН (Россия): выполнение цикла работ по исследованию структуры биополимеров с использованием спиновых меток

- Институт физики полупроводников имени А. В. Ржанова СО РАН (Россия): разработаны элементы биосенсорных систем

- Институт неорганической химии имени А. В. Николаева СО РАН (Россия): совместные исследования искусственных мембранных структур

- Новосибирский национальный исследовательский государственный университет (Россия): разработка оригинальных специальных курсов для студентов университета, организация научной практики в Лаборатории, выполнение дипломных и диссертационных работ

- Институт цитологии и генетики СО РАН (Россия), Институт биоорганической химии имени академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова РАН (Россия), Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» (Россия), МГУ имени М. В. Ломоносова (Россия), Страсбургский университет (Франция), Манчестерский университет (Великобритания): разработка методов лечения социально-значимых заболеваний

- МГУ имени М. В. Ломоносова (Россия), Страсбургский университет (Франция), Манчестерский университет (Великобритания): организация стажировок

- Лимнологический институт СО РАН (Россия): совместные исследования

- ООО «Медико-биологический союз» (Россия): разработка систем диагностики социально значимых заболеваний

Скрыть Показать полностью
Altman S.
Antibiotics: Present and Future. FEBS Journal 280(1): 1 (2013).
Apartsin E.K., Buyanova M., Novopashina D.S., Ryabchikova E.I., Filatov A.V., Zenkova M.A., Venyaminova A.G.
Novel Multifunctional Hybrids of Single-Walled Carbon Nanotubes with Nucleic Acids: Synthesis and Interactions with Living Cells. ACS Applied Materials & Interfaces 6(3): 1454–1461 (2014).
Kupryushkin M.S., Nekrasov M.D., Stetsenko D.A., Pyshnyi D.V.
Efficient Functionalization of Oligonucleotides by New Achiral Nonnucleosidic Monomers. Organic Letters 16(11): 2842–2845 (2014).
Shevelev G.Yu., Krumkacheva O.A., Lomzov A.A., Kuzhelev A.A., Rogozhnikova O.Yu., Trukhin D.V., Troitskaya T.I., Tormyshev V.M., Fedin M.V., Pyshnyi D.V., Bagryanskaya E.G.
Physiological-Temperature Distance Measurement in Nucleic Acid using Triarylmethyl-Based Spin Labels and Pulsed Dipolar EPR Spectroscopy. Journal of the American Chemical Society 136(28): 9874–9777 (2014).
Davydova A., Vorobjeva M., Pyshnyi D., Altman Sidney, Vlassov V., Venyaminova A.
Aptamers against Pathogenic Microorganisms. Critical Reviews in Microbiology 42(6): 847–865 (2015).
Фотоальбомы
Вторник , 03.12.2019
Другие лаборатории и ученые
Лаборатория, принимающая организация
Область наук
Город
Приглашенный ученый
Период реализации проекта
Лаборатория сверхэластичных биоинтерфейсов

Томский государственный университет (НИУ) - (ТГУ)

Медицинские биотехнологии

Томск

Волынский Алексей Александрович

США, Россия

2021-2023

Лаборатория омиксных технологий и больших данных для персонализированной медицины и здоровья

Сколковский институт науки и технологий - (Сколтех)

Медицинские биотехнологии

Москва

Борхерс Кристоф Германн

Германия

2019-2023

Лаборатория молекулярного имиджинга

Федеральный исследовательский центр «Фундаментальные основы биотехнологии» РАН - (ФИЦ Биотехнологии РАН)

Медицинские биотехнологии

Москва

Богданов Алексей Алексеевич

США, Россия

Жердева Виктория Вячеславовна

Россия

2018-2020