МЕГАГРАНТЫ

Лаборатория геномного редактирования

О лаборатории

Лаборатория создана в рамках гранта Правительства Российской Федерации, выделенного на конкурсной основе для государственной поддержки научных исследований, проводимых под руководством ведущих ученых в российских образовательных учреждениях высшего профессионального образования (постановление правительства №220 от 9 апреля 2010 года).

№ договора:

14.W03.31.0007

Наименование проекта
Молекулярные механизмы РНК-интеференции и защиты геномов у бактерий и эукариот.

Наименование организации
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт молекулярной генетики Российской академии наук

Область научных исследований
Биология

Цель данного проекта изучение функций коротких некодирующих РНК у эу- и прокариот и разработка новых подходов к использованию РНК-интерференции в качестве инструмента редактирования геномов в фундаментальных и прикладных исследованиях, а также в терапевтических целях.

Ведущий учёный

aravinimage 

ФИО: Аравин Алексей Алексеевич

 

Дата рождения 02.11.1976

Гражданство
Россия

Ученые степень и звание
Профессор

Место работы
Калифорнийский технологический институт, США

Область научных интересов
Область научных интересов Биология РНК, регуляция экспрессии генов, эпигенетика, мобильные элементы

Достижения и награды
Профессор А.А. Аравин – один из ведущих ученых в области исследований биологии РНК и регуляции экспрессии генов. Ему принадлежит открытие нового класса некодирующих РНК, которое в свое время было отмечено как одно из важнейших открытий года журналом Science. Продолжение этих работ позволило понять функции некодирующих РНК в защите геномов от мобильных генетических элементов. Начиная с 2010 года, профессор А.А. Аравин возглавляет лабораторию в одном из ведущих мировых университетов – Калифорнийском технологическом институте. Проводимые им исследования по всем критериям находятся на самом высоком уровне, а их результаты опубликованы более чем в 60 высокоцитируемых статьях в лучших международных журналах. Работа А.А. Аравина получила финансовую поддержку основных научных фондов США. Профессор А.А. Аравин неоднократно выступал в качестве приглашенного лектора на крупнейших международных конференциях. Он награжден многими престижными наградами, включая высшую награду Национального института здоровья (NIH) для молодых исследователей, награду директора NIH в области инноваций и награду фонда Паккардов в области науки и технологий..


Y. Chen, E. Stuwe, Y. Luo, M. Ninova, A. Le Thomas, E. Rozhavskaya, S. Li, S. Vempati, J. Laver,
D. Patel, C. Smibert, H. Lipshitz, K. Fejes Tóth and A. Aravin (2016) Cutoff suppresses RNA
polymerase II termination to ensure expression of piRNA precursors. Molecular Cell. In press.
J. Hur, Y. Luo, S. Moon, M. Ninova, G. Marinov, Y. Chung and A. Aravin (2016) Splicingindependent
loading of TREX on nascent RNA is required for efficient expression of dual-strand
piRNA clusters in Drosophila. Genes & Development. 30(7):840-55
A. Webster, S. Li, J. Hur, M. Wachsmuth, J. Bois, E. Perkins, D. Patel and A. Aravin (2015) Aub
and Ago3 are recruited to nuage through two mechanisms to form a ping-pong complex assembled
by Krimper. Molecular Cell. 59(4):564-75. doi: 10.1016/j.molcel.2015.07.017
S. Manakov, D. Pezic, G. Marinov, W. Pastor, R. Sachidanandam and A. Aravin (2015) MIWI2 and
MILI have differential effects on piRNA biogenesis and DNA methylation. Cell Reports. 12(8):1234-
1243. doi: 10.1016/j.celrep.2015.07.036.
Cheloufi S, Elling U, Hopfgartner B, Jung YL, Murn J, Ninova M, Hubmann M, Badeaux AI, Euong
Ang C, Tenen D, Wesche DJ, Abazova N, Hogue M, Tasdemir N, Brumbaugh J, Rathert P, Jude J,
Ferrari F, Blanco A, Fellner M, Wenzel D, Zinner M, Vidal SE, Bell O, Stadtfeld M, Chang HY,
Almouzni G, Lowe SW, Rinn J, Wernig M, Aravin A, Shi Y, Park PJ, Penninger JM, Zuber J,
Hochedlinger K. (2015) The histone chaperone CAF-1 safeguards somatic cell identity. Nature.
528(7581):218-24. doi: 10.1038/nature15749
Marinov GK, Wang J, Handler D, Wold BJ, Weng Z, Hannon GJ, Aravin AA, Zamore PD,
Brennecke J, Fejes Tóth K. (2015) Pitfalls of mapping high-throughput sequencing data to
repetitive sequences: Piwi's genomic targets still not identified. Dev Cell. 32(6):765-71. doi:
10.1016/j.devcel.2015.01.013.
A. Le Thomas, G. Marinov and A. Aravin (2014). A Transgenerational Process Defines piRNA
Biogenesis in Drosophila virilis. Cell Reports. pii: S2211-1247(14)00676-7.
A. Le Thomas, E. Stuwe, S. Li, J. Du, G. Marinov, N. Rozhkov, YC. Chen, Y. Luo, R.
Sachidanandam, K. Fejes Tóth, D. Patel and A. Aravin (2014). Transgenerationally inherited
piRNAs trigger piRNA biogenesis by changing the chromatin of piRNA clusters and inducing
precursor processing. Genes & Development 28(15):1667-80.
D. Pezic, S. Manakov, R. Sachidanandam and A. Aravin (2014) piRNA pathway targets active
LINE1 elements to establish the repressive H3K9me3 mark in germ cells. Genes & Development.
28(13):1410-28. doi: 10.1101/gad.240895.114
Pastor WA, Stroud H, Nee K, Liu W, Pezic D, Manakov S, Lee SA, Moissiard G, Zamudio N,
Bourc'his D, Aravin AA, Clark AT, Jacobsen SE. (2014) MORC1 represses transposable elements
in the mouse male germline. Nat Commun. 5:5795.
Molaro A, Falciatori I, Hodges E, Aravin AA, Marran K, Rafii S, McCombie WR, Smith AD, Hannon
GJ. (2014) Two waves of de novo methylation during mouse germ cell development. Genes &
Development 28(14):1544-9.
I. Olovnikov, K. Chan, R. Sachidanandam, D. Newman, A. Aravin (2013) Bacterial Argonaute
samples the transcriptome to identify foreign DNA. Molecular Cell. 51(5):594-605.
A. Le Thomas, A. Rogers, A. Webster, G. Marinov, S. Liao, E. Perkins, J. Hur, A. Aravin, and K.
Fejes Tóth (2013) Piwi induces piRNA-guided transcriptional silencing and establishment of a
repressive chromatin state. Genes & Development 27 (4)
Muerdter F, Olovnikov I, Molaro A, Rozhkov NV, Czech B, Gordon A, Hannon GJ, Aravin AA.
(2012). Production of artificial piRNAs in flies and mice. RNA. 18(1):42-52

Back to top